Généralités sur la tuberculose

Table des matières

DEDICACE
REMERCIEMENTS
RESUME
ABSTRACT
TABLE DES MATIERES
GLOSSAIRE
LISTE DES TABLEAUX
LISTE DES FIGURES
I INTRODUCTION
II GENERALITES
Generalites sur la tuberculose
IDe l’infection à la maladie
Diagnostic
Traitement
Prévention
Les mycobactéries
Taxonomie
Caractéristiques de M. tuberculosis
Caracteristiques morphologiques et phenotypiques
Le génome de M.tuberculosis
Les marqueurs genetiques de M.tuberculosis
Méthodes de génotypage de M. tuberculosis
Classification des souches du complexe M.tuberculosis (MTBC)
Base de données
Epidémiologie moléculaire des souches M. tuberculosis à Madagascar
Etude épidémiologique de la tuberculose utilisant le système d’information géographique (SIG)
MATERIELS ET METHODES
Recrutement
Methodes
Extraction d’ADN à partir de lames de diagnostic
Principe
Méthodes
Spoligotyping
Principe
Méthodes
Enregistrement des données
Attribution des numeros IPM
Saisie des données et résultats sur Excel
Validation des résultats
Classification des souches
Analyse des clusters spatiaux de cas de tuberculose à Antananarivo
Cartographie des Spoligotypes sur le logiciel Quantum Gis®
Association cluster spatial de cas et cluster génotypique
Analyse statistique
RESULTATS
Caractéristiques de la population d’étude
Distribution des patients selon leur tranche d’âge et leur sexe
ANALYSE BACTERIOLOGIQUE des échantillons
Résultat du spoligotyping sur membrane
Genotypage des extraits de lames et de cultures
Description des spoligotypes par comparaison des profils obtenus à la base de données internationale (Sitvitweb)
Description des spoligotypes obtenus à partir des ADN extraits des lames de diagnostic
Description et distribution des spoligotypes obtenus à partir des ADN extraits de culture distribution des spoligotypes concordants entre les profils d’extraits de lame et culture
Définition du nouveau cluster spatial de cas de tuberculose
Cartographie des spoligotypes majeurs de M. tuberculosis à Antananarivo renivohitra a partir des extraits de cultures
IV.9 Analyse association cluster spatial de cas et clusters génotypiques à partir des extraits de cultures
V DISCUSSION
VI CONCLUSION ET PERSPECTIVES
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANNEXES